L'istruzione Matlab necessaria per modellizzare il filtro IIR è la seguente: [b a]=butter (n, wn, type). Nel dettaglio troviamo “b” ed “a” che sono i coefficienti del filtro e saranno il risultato dell'istruzione. I parametri da passare sono rispettivamente: “n” che rappresenta l'ordine del filtro, “wn” che indica la frequenza di taglio normalizzata secondo la frequenza di Nyquist (metà della frequenza di campionamento) e infine “type”, che specifica il tipo di filtro e può essere “low”, ”high”, “stop” a seconda che il filtro sia rispettivamente passa-basso, passa-alto, passa-banda (in quest'ultimo caso “wn” sarà un vettore contente gli estremi del range di frequenza che si vuole far passare). Per visualizzare la funzione di trasferimento del filtro è utile usare la seguente istruzione: freqz(a, b, freq_Nyquist). I filtri IIR hanno il difetto di introdurre uno sfasamento non lineare della fase del segnale: il segnale dopo essere stato filtrato appare traslato lungo l'asse delle x, come se fosse ritardato. Per ovviare a questo problema Matlab mette a disposizione l'istruzione filtfilt (b, a, segnale) che, dopo aver filtrato il segnale, lo rifasa in modo da cancellare il ritardo.